Aktionen

World Community Grid/FightAIDS@Home

Aus SETI.Germany Wiki

FightAIDS@Home
FightAIDS@Home
Ziel:Finde ein Heilmittel gegen AIDS
Kategorie:Medizin
Hauptprojekt:World Community Grid
Homepage:http://www.worldcommunitygrid.org/
Betreiber:Scripps Research Institute Vereinigte Staaten von Amerika
Status:produktiv
Projektadressen
Forum:FightAIDS@Home Forum
SETI.Germany
Team-Statistik:FightAIDS@Home
Teambeitritt:SETI.Germany beitreten
Teamwerbung:Für FightAIDS@Home werben
Twitter Facebook meinVZ/studiVZ
Forenthread:SETI.Germany Forum
Workunit
Frist:10 Tage
Laufzeit:
  • 7 Stunden
    (i7 860)
Download:ca. 100 KB
Upload:ca. 100 KB
Arbeitsspeicher:bis 168 MB
Betriebssysteme:Android Linux 32 Bit Mac OS (64 Bit) Windows 32 Bit
Bildschirmschoner:Vorhanden
Checkpoints:Vorhanden

FightAIDS@Home Phase 1 ist ein Projekt des amerikanischen Scripps Research Institute zur Medikamentensuche gegen AIDS.

Das Projekt wird innerhalb des World Community Grids durchgeführt.

Projektstatus und Ergebnisse

FightAIDS@Home Projekt ist das erste World Community Grid Projekt welches auf Android Smartphones und Tablets läuft. Mit dem Start der BOINC für Android App im Juli 2013 hat Volunteer Computing, beginnend mit diesem Projekt, einen Sprung vorwärts gemacht. Freiwillige können nun diese kritische Forschung mit ihren mobilen Geräten beschleunigen. Weiterlesen oder Registrieren bei WCG.

Auch der Kampf gegen AIDS hat vor kurzem einen weiteren Schub bekommen, als das World Community Grid Team ein neues Modellierungsinstrument, das von den Scripps Forschern entwickelt wurde, für das FightAIDS@Home Projekt entwickelt hat . Dieses neue Werkzeug, genannt Vina, ist genauer und wesentlich schneller als das ursprüngliche Werkzeug, genannt AutoDock, beim Screening hochflexibler Verbindungen. Allerdings ist AutoDock genauer in anderen Experimenten. Die Forscher können daher das ideale Werkzeug für die jeweilige Aufgabe wählen.

Weitere Informationen zu diesem Projekt finden Sie auf diesen Seiten, einschließlich der Projekt News & Updates des Projekts. Sie können auch die FightAIDS@Home Webseite der Forscher besuchen, wo Sie den aktuellen Statusbericht finden können. Um dieses Projekt zu kommentieren oder Fragen darüber zu stellen, reichen Sie bitte eine Nachricht in das FightAIDS@Home Forum ein.

Statusberichte

Was ist AIDS?

Hiv pr docking.gif
UNAIDS, das gemeinsame Programm der vereinten Nationen (UN) für HIV/AIDS, schätzte, dass 2004 mehr als 40 Millionen Menschen weltweit mit HIV - dem menschliche Immunschwächevirus - leben. Das Virus hat das Leben von Männern, Frauen und Kindern in der ganzen Welt betroffen. Derzeit ist kein Heilmittel in Sicht, nur Behandlung mit einer Vielfalt von Medikamenten.

Prof. Arthur J. Olson's laboratory am Scripps Research Institute (TSRI) studiert Wege, wie man mit Computern neue Anti-HIV-Medikamente, basierend auf molekularen Strukturen, entwickeln kann. Es ist mehrmals bewiesen worden, dass die Funktion eines Moleküls – eine Substanz bestehend aus vielen Atomen – im Bezug zu seiner dreidimensionalen Form steht. Olsons Ziel ist die HIV-Protease, eine molekulare Schlüsselmaschine des Virus, die erst einmal geblockt, das Virus bei seiner Entwicklung stoppt. Diese Blocker, bekannt als „Proteasehemmstoffe,“ sind demnach ein Weg den Ausbruch von AIDS zu vermeiden und das Leben zu verlängern.

Das Olson-Laboratorium benutzt computerunterstützte Methoden, um neue Wirkstoffe zu identifizieren, welche die richtige Form und chemischen Eigenschaften haben, um die HIV-Protease zu blockieren. Dieses allgemeine Vorgehen wird die „strukturbasierte Medikamentenkreation,“ genannt und gemäß des National Institutes of Health's National Institute of General Medical Sciences hat es bereits einen tiefgreifenden Effekt auf das Leben von Menschen, die mit AIDS leben müssen.

Noch viel herausfordernder ist, dass HIV ein “schlampiger Kopierer” ist, deshalb bringt es ständig neue Varianten hervor und einige von ihnen sind resistent gegen aktuelle Medikamente. Es ist daher entscheidend, dass Wissenschaftler ihre Suche nach neuen und besseren Medikamenten fortführen, um dieses sich bewegende Ziel zu bekämpfen.

Wissenschaftler sind fähig durch Experimente die Formen eines Proteins und eines Medikamentes separat zu ermitteln, aber nicht immer für beide zusammen. Wenn man wüßte, wie ein Medikamentenmolekül in die aktive Stelle seines Zielproteins passt, könnten Chemiker sehen, wie sie besser Medikamente kreieren könnte, die wirksamer wären als die heutigen.

Um diese Herausforderungen anzugehen, betreibt das FightAIDS@Home-Projekt von World Community Grid eines von zwei Softwareprogramme, genannt AutoDock, das andere gennant AutoDock Vina (AD Vina), entwickelt in Prof. Olsons Laboratorium. AutoDock ist eine Sammlung von Werkzeugen, die vorhersagt wie kleine Moleküle, die als Wirkstoffkandidaten in Frage kommen, sich an einen Rezeptor von bekannten 3D-Strukturen binden oder andocken lassen. Die allererste Version von AutoDock wurde im Olson-Laboratorium 1990 geschrieben von Dr. David S. Goodsell. Seit dem sind neuere Versionen, umgesetzt von Dr. Garrett M. Morris, veröffentlicht worden, die neues wissenschaftliches Verständnis und Strategien für Autodock hinzufügen und es robuster, schneller und einfacher benutzbar für andere Wissenschaftler macht. Bisher hat das FightAIDS@Home-Projekt seine Berechnungen auf der AutoDock-Software durchgeführt, aber die Forscher finden, dass das neuere Docking-Programm, AD Vina, genauer in "Positivkontrolle" -Experimenten ist. Darüber hinaus AD Vina läuft in der Regel 10 bis 100 mal schneller als AutoDock. In einigen Fällen jedoch kann AutoDock genauer sein als AD Vina - jeder bietet komplementäre Arten von Daten, die Forscher können miteinander vergleichen wollen. Daher wird ab Juli 2013 entweder eines oder beide dieser Softwareprogramme in Abhängigkeit von den Arten von Molekülen, die angedockt werden, und dem speziellen Ziel, an dem sie angedockt sind, für dieses Projekt verwendet. Sowohl AutoDock als auch AD Vina werden im FightAIDS @ Home-Projekt auf dem World Community Grid eingesetzt, um Millionen von verschiedenen kleinen Molekülen an HIV-Protease, HIV-Integrase und HIV Reverse Transkriptase anzukoppeln, so dass die vielversprechendsten Moleküle rechnerisch identifiziert und dann beschafft werden können, getestet in den Laboratorien der zusammenarbeitenden Experimentatoren, um festzustellen, wie stark sie beim Herunterfahren der Aktivität der Enzyme sind, die das HIV Virus verwendet, um zu replizieren und zu verbreiten. Mit dem Zusammenschluss können das Scripps Research Institute, das World Community Grid und seine wachsende Streitmacht der Freiwilligen bessere HIV-Behandlungen schneller finden als je zuvor.

Gepatchte Version

Für die Version 6.40 des FAAH-Clients steht für AMD-Prozessoren, die mindestens SSE2 unterstützen, eine gepatchte Version zur Verfügung. Der Programmalgorithmus wird durch das Patch nicht verändert. Es werden lediglich Intel-only-Abfragen nicht durchgeführt. Hierdurch wird der Programmablauf beschleunigt. Installationsanleitung und Download im P3D-Forum

Wichtig: Nur bei AMD-Prozessoren einsetzen!

Single Sign On provided by vBSSO